样品变异位点(SNP和Indel)的检测已经广泛应用于动植物、微生物的基因定位研究。研究者根据样品的特殊性及研究的特点,相继开发了测序法、质谱法及探针法等。而今天小编给大家介绍一种,适合高通量、更快速度、更低成本以及更加精确的新方法。其实这个方法也不算新了,人们使用这个方法定位了很多功能基因,并已发表多篇高水平文章。既然这个方法这么好,那么下面小编就给大家简单地介绍下KASP基因分型技术,以及博美达一站式SNP检测服务。
KASP基因分型技术介绍
KASPTM指竞争性等位基因特异性PCR(KompetitiveAlleleSpecificPCR),是一种针对已知SNP位点分析的高效基因分型技术,可对目标SNPs和InDels进行精准的双等位基因分型。通过两个位点特异探针以及2个荧光探针来检则多个SNP位点,以及利用全自动一体化DNA抽提及荧光定量PCR工作平台,可以快速检测大量SNP位点,在医学及农学检测方面KASP都有非常多的应用。
博美达KASP技术平台优势
1
分型结果准确
准确度99.8%
行业里领先的SNP和InDel分析转化率(90%)。基于终端荧光读取判断,每孔采用双色荧光检测一个样本的一个位点可能的两种基因型,不同的SNP模板对应不同的荧光产物。
2
检测成本低
不需要每个SNP位点都去合成特异的荧光引物,它基于自己独特的ARMPCR原理,让所有的位点检测最终都使用通用荧光引物扩增,这大大降低了试剂成本。合成的探针可用于上千样本的检测。
3
节省样品
每个SNP检测仅需样本1-10ngDNA(根据人类基因组大小测算)。
4
检测时间短
全自动的工作平台及超大通量,使得实验最短的时间内完成检测。
5
检测通量高
自动一体化DNA抽提、荧光定量PCR工作平台,使得能够批量操作96通道或通道样品,处理及加样的一致性较好,实现大量样品及位点检测。
6
一站式服务
从提供生物样本开始,进行探针设计、DNA抽提、检测到分析结果。提供省心省力的一站式服务。
服务价格表
NOTE:项目总费用=核酸抽提+KASP引物合成+基因型鉴定
参考文献
DevelopmentofSNPGenotypingAssaysforSeedCompositionTraitsinSoybeanGunvantPatil,JuhiChaudhary,TriD.Vuong,BrianJenkins,DanQiu,SuhasKadam,GroverJ.Shannon,HenryT.NguyenIntJPlantGenomics.;:.PublishedonlineMay25.
AKASPGenotypingMethodtoIdentifyNorthernWatermilfoil,EurasianWatermilfoil,andTheirInterspecificHybrids
EricL.Patterson,MargaretB.Fleming,KallieC.Kessler,ScottJ.Nissen,ToddA.GainesFrontPlantSci.;8:.PublishedonlineMay8.
ValidatingDNAPolymorphismsUsingKASPAssayinPrairieCordgrass(SpartinapectinataLink)PopulationsintheU.S.HannahGraves,A.L.Rayburn,JoseL.Gonzalez-Hernandez,GyoungjuNah,Do-SoonKim,D.K.LeeFrontPlantSci.;6:.PublishedonlineJan22.
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